对于灵活就业者，其医保停保的办理流程如下：
1、了解停保政策：灵活就业者需要了解医保停保的政策和规定，例如停保期限、停保条件、停保手续等；
2、提交申请：停保期限到来前，灵活就业者需要提前向当地的社保服务部门提交停保申请，填写《中华人民共和国社会保险法定个人缴费基数变更申请表》和《城乡居民医疗保险参保关系管理申请表》等相关表格，并提供身份证、医保卡及其他相关证明材料；
3、审核通过：社保服务部门将对申请材料进行审核，审核通过后，灵活就业者的医保参保关系将被注销，医保缴费将停止；
4、缴费停止：注销医保参保关系后，灵活就业者不再需要缴纳医保费用。如在停保期限内需要继续享受医保待遇，需要重新申请参保。
灵活就业者停保期间的影响主要有以下几点：
1、停止享受医保待遇：医保停保后，灵活就业者将无法享受医保待遇，即不能再通过医保报销医疗费用，需要自费支付医疗费用；
2、保障缺失：灵活就业者在医保停保期间，将会面临医疗保障的缺失，一旦发生意外或突发疾病，将需要自费或通过商业保险来解决；
3、参保时效问题：医保停保期间，灵活就业者的医保参保状态将被注销，如未在规定期限内重新参保，可能会影响到日后的参保时效；
4、续保限制：在停保期间内，灵活就业者如需再次参保，需要重新提交申请，并按照规定缴纳医保费用，但在某些地区，可能存在着连续参保月数的限制，灵活就业者需要提前了解当地的政策和规定。
综上所述，不同地区的停保政策和流程可能会有所不同，灵活就业者在申请停保前，建议先了解当地的政策和规定，并按照规定提交申请。同时，在停保期间内，如果需要就医，建议提前了解自费和医保报销的情况，以免影响就医。
停保手续包括了了解政策、提交申请、审核通过和缴费停止。停保期间影响主要有医保待遇停止、保障缺失和参保时效问题。