自费疫苗是可以使用医保卡来报销。如果参保人员所产生的医疗费用在基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准等范围之内的,就可以用医保卡来直接进行结算。符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用,按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。