取消农村合作医疗的流程如下：
1．个人前往户籍所在地的民政大厅提出暂停缴纳农村合作医疗的申请；
2．工作人员会对账户进行冻结操作，申请人确认签字后完成暂停手续；
3．转交职工医疗而需暂停新农合，新农合会自动失效；
4．乡级管理机构审核相关证明并签署意见，连同缴费证和缴费记录卡上报县级保险机构，由县级机构审核并核算退保金数额。
农村合作医疗的历史背景：
1、起源：农村合作医疗起源于20世纪50年代的中国，是一种基于农村集体经济组织的医疗互助形式；
2、发展：在20世纪70年代，农村合作医疗覆盖了大部分的中国农村地区，成为农民得到基本医疗服务的主要方式；
3、衰退：随着80年代农村经济体制的改革，原有的农村合作医疗体系逐渐解体，覆盖率大幅下降；
4、改革：21世纪初，中国政府开始推行新型农村合作医疗制度，即新型农村合作医疗保险（新农合），以改善农村医疗保障水平；
5、整合：随着医疗保障体系的完善，新农合与城镇居民医保合并，形成了统一的城乡居民基本医疗保险制度。
综上所述，取消农村合作医疗需个人前往户籍地民政大厅申请，经账户冻结、签字确认后，若转职工医疗则新农合自动失效，乡级管理机构审核后，县级保险机构负责最终审核及退保金核算。
农村合作医疗的取消流程包括个人申请暂停，经过账户冻结确认，转职工医疗时自动失效，最终由乡级管理机构审核退保金。