合作医疗卡丢了怎么补办如下：
1、医疗保险卡出现丢失就会选择补卡或者换卡。补办卡应先行预挂失经确认后，挂失的社保卡停止结算功能。预挂失有效期10天，超过后自动解挂，社保卡恢复正常使用。如果急于看病就医可到本市任意的社保卡服务网点办理撤销挂失手续；
2、预挂失之后，正式挂失手续应由本人办理，特殊情况下如行动不便、高龄等可委托他人代办。挂失人应出示本人身份证，委托他人代办的，须同时提供被委托人的身份证原件与复印件；
3、在正式挂失的同时应办理补卡手续，当场填写申请单，交给社保卡服务网点工作人员办理后开具领卡证明，该证明可作为补卡人补卡期间的临时就医凭证。15个工作日后，补卡人持本人的身份证和领卡证明到社保卡服务网点领取新卡。先挂失，医疗费用先垫付，出院后带上发票以及出院小结和总的结算清单一起到社保中心办理报销。
合作医疗卡补办注意事项：
1、办好合作医疗卡后，参合人员应仔细核对卡上的姓名、家庭住址是否正确，如发现存在错误的，应及时与乡镇卫生院合管科工作人员联系更改；
2、就医时请随身携带合作医疗卡。参合农民携此卡可在新农合定点医疗机构获得相应医药费用的报销，实行现场即时结报；
3、请广大参合农民妥善保管好合作医疗卡，不要将其放在乡村医生或他人手中，以免他人利用合作医疗卡套取新农合基金，影响您的正常受益。
综上所述，首先预约挂失。挂失分为口头挂失和书面挂失两种方式。其次正式挂失。预约挂失后办理正式挂失，预挂失期间如果找到了社保卡，可以取消挂失。最后办理补卡。在新农合服务网点，填写申请单，工作人员会开具一张领卡证明，在十五个工作日后可携带此证明到新农合服务网点领取新卡。农村合作医疗卡丢了需要去县卫生局新农合办公室补办，参保人持有户口本或身份证，即可申请办理农村合作医疗卡。通常是当天办理，当天就可以领到新卡，但如果有特殊情况，区农村合作医疗办也会给大家在规定的时间内进行新卡补办。
合作医疗卡丢失补办需办理挂失手续，办理补卡手续，注意携带卡就医，及时核对信息，遵循规定办理报销手续。